Seqüenciamento de genoma completo de duas cepas de Klebsiella pneumoniae *ST442 produtoras de KPC isoladas em São Paulo com quatro anos de diferença (2011)
- Authors:
- USP affiliated authors: SAMPAIO, JORGE LUIZ MELLO - FCF ; HUENUMAN, NILTON ERBET LINCOPAN - ICB ; MAMIZUKA, ELSA MASAE - FCF
- Unidades: FCF; ICB
- Subjects: GENOMAS; MICROBIOLOGIA
- Language: Português
- Abstract: No ambiente hospitalar Klebsiella pneumoniae é um dos principais agentes de infecção nosocomial, principalmente do trato respiratório inferior e trato urinário, produzindo bacteremias e septicemias associadas. No Brasil, K. pneumoniae é a espécie que apresenta a mais alta produção de beta-lactamases de espectro estendido (ESBL), dentre as quais, inclui-se a carbapenemase KPC (Klebsiella pneumoniae Carbapenemase), que é uma beta-lactamase classe A. Aqui, apresentamos a sequência completa do cromossomo da primeira cepa produtora de KPC isolada no Brasil (FCF13/05), isolada de uma hemocultura em maio de 2005 e a sequência genômica de outra cepa de K. pneumoniae produtora de KPC (FCF/3SP), isolada também de hemocultura quatro anos depois em 2009. As sequências foram obtidas a partir de leituras curtas pareadas geradas pela plataforma SOLiD v3 usando DNA genômico total de cada cepa, pela Rede Paraense de Genômica e Proteômica. Os genomas foram montados usando como referência a sequência da cepa MGH78578 (GenBank NC_009648), usando o CLC Genomics Workbench 4.7.1.Os scaffolds dos cromossomas das cepas FCF13/05 e FCF/3SP foram anotados com o auxílio do pipeline RAST e Glimmer 3.02 para predizer CDSs, tRNAscan-SE 1.21 para predizer genes de tRNA e RNAmmer 1.2 para predizer genes de rRNA. MLST in silico confirmou que as duas cepas pertencem à linhagem ST442, e que, portanto, possuem um ancestral comum. A linhagem ST442 não possui complexo clonal, só há descrição de seu isolamento na Noruega. Esse é o primeiro relato de produção de KPC na linhagem ST442. Tanto a cepa FCF13/05 quanto FCF/3SP apresentaram mutações em pelo menos uma das proteínas do sistema de reparo tipo Mismatch Repair (MutL, MutS e MutH), sugerindo que possuam fenótipo mutador, o que poderia ser vantajoso no ambiente hospitalar devido a uma maior flexibilidade para se adaptar à pressão seletiva imposta pelo uso de antibióticos. Por pertencerem à mesma linhagem e terem sido isoladas com quatro anos de diferença, de casos clínicos similares, as sequências cromossomais de cada cepa poderão ser usadas para avaliar a evolução genômica de Klebsiella pneumoniae produtora de KPC
- Imprenta:
- Publisher: Sociedade Brasileira de Microbiologia (SBM)
- Publisher place: São Paulo
- Date published: 2011
- Conference titles: Congresso Brasileiro de Microbiologia
-
ABNT
QUEIROZ, Maíse Gomes et al. Seqüenciamento de genoma completo de duas cepas de Klebsiella pneumoniae *ST442 produtoras de KPC isoladas em São Paulo com quatro anos de diferença. 2011, Anais.. São Paulo: Sociedade Brasileira de Microbiologia (SBM), 2011. . Acesso em: 29 maio 2024. -
APA
Queiroz, M. G., Cerdeira, L. T., Almeida, E. L., Pavez, M., Chaparro, P. J. P., Levy, C. E., et al. (2011). Seqüenciamento de genoma completo de duas cepas de Klebsiella pneumoniae *ST442 produtoras de KPC isoladas em São Paulo com quatro anos de diferença. In . São Paulo: Sociedade Brasileira de Microbiologia (SBM). -
NLM
Queiroz MG, Cerdeira LT, Almeida EL, Pavez M, Chaparro PJP, Levy CE, Sampaio JLM, Huenuman NEL, Mamizuka EM, Mcculloch A. Seqüenciamento de genoma completo de duas cepas de Klebsiella pneumoniae *ST442 produtoras de KPC isoladas em São Paulo com quatro anos de diferença. 2011 ;[citado 2024 maio 29 ] -
Vancouver
Queiroz MG, Cerdeira LT, Almeida EL, Pavez M, Chaparro PJP, Levy CE, Sampaio JLM, Huenuman NEL, Mamizuka EM, Mcculloch A. Seqüenciamento de genoma completo de duas cepas de Klebsiella pneumoniae *ST442 produtoras de KPC isoladas em São Paulo com quatro anos de diferença. 2011 ;[citado 2024 maio 29 ] - Linezolid resistance in vancomycin-resistant Enterococcus faecalis and Enterococcus faecium isolates in a brazilian hospital [Editorial]
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